Tuyến trùng có hệ tiêu hóa gồm ba phần. Ba phần này là dạ dày, ruột và hậu môn. Dạ dày bao gồm miệng, thực quản và hầu. Khi thức ăn được đưa vào qua miệng ở một đầu của tuyến trùng, thức ăn sẽ đi qua thực quản rồi vào ruột. Thực quản bơm thức ăn đã được tuyến trùng đưa vào ruột như đã đề cập. Khi thức ăn di chuyển xuống ruột hình ống, nó sẽ đến một phần được gọi là một trong hai phần. Ở con đực, nó được gọi là lỗ huyệt, và ở con cái, nó được gọi là trực tràng.

Thức ăn đã được tiêu hóa lúc này đã phân hủy các khoáng chất cần thiết cho toàn bộ cơ thể, và phần thức ăn còn lại có thể được thải ra ngoài dưới dạng chất thải ở phần cuối của tuyến trùng. Phần này được gọi là hậu môn.

Các loại tuyến trùng tìm thấy trong đất Nông Nghiệp: Có 5 loại được tìm thấy sau đây:

1. Tuyến trùng ăn hại rễ cây (Root Feeder): Tuyến trùng ăn rễ cây chiếm đa số trong các loài tuyến trùng được biết đến, miệng của tuyến trùng loại này bao gồm một kim nhỏ dùng để đâm vào rễ cây khi ăn.

Có hai loài ăn cỏ chính là:
– Ectoparisites, ăn ở mặt ngoài của rễ và
– Endoparisites, ăn ở bên trong rễ, làm cây mất dinh dưỡng và nước, có thể là cây vàng lá và chết.
2. Tuyền trùng ăn vi khuẩn trong đất (Bacterial Feeder): Đây là những tuyến trùng chủ yếu có lợi cho quá trình phân hủy và chu trình cung cấp hệ dinh dưỡng. Miệng của tuyến trùng ăn vi khuẩn là một lỗ rỗng cho phép vi khuẩn xâm nhập vào. Vi khuẩn có mặt ở khắp mọi nơi trong đất.
3. Tuyến trùng ăn nấm (Fungal feeder): Những tuyến trùng này cũng rất quan trọng trong quá trình phân hủy và chu trình cung cấp dinh dưỡng cho đất. Miệng tương tự như miệng của động vật ăn rễ cây đó là dùng một kim nhỏ được thiết kế để đâm thủng sợi nấm trong quá trình ăn.
4. Tuyến trùng ăn thịt (Predator): Những loài tuyến trùng này rất hữu ích trong việc ngăn chặn một số quần thể nhất định do sở thích săn mồi của chúng, như sùng, côn trùng đất… Hầu hết các loài ăn thịt đều ăn các loài tuyến trùng ký sinh thực vật khác và các loài tuyến trùng sống tự do khác; mặc dù chúng có thể ăn động vật nguyên sinh và thậm chí cả một số loài côn trùng. Miệng của chúng là một lỗ được thiết kế để bám vào vật chủ, và một kim chích được thiết kế để cạo mô của vật chủ.
5. Tuyên trùng ăn tạp (Ominvore): Tuyến trùng ăn tạp thường thích ăn thực vật, vi khuẩn và nấm; mặc dù nếu nguồn thức ăn của chúng khan hiếm, chúng sẽ ăn các loài tuyến trùng khác và côn trùng khác. Miệng của chúng tương tự như tuyến trùng săn mồi.

Miệng và thực quản của 5 loại tuyến trùng

a- TT ăn vi khuẩn        b-TT ăn nấm         c- TT ăn rễ cây    d- TT trùng ăn thịt        e-TT ăn tạp

Ngoài ra, có lọai tuyến trùng chưa rõ: Có nhiều loài tuyến trùng chưa được nghiên cứu nhiều, do đó nguồn thức ăn của chúng vẫn chưa được biết đến.